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sed コマンドと行の書式設定

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sed コマンドと行の書式設定

次のヘッダーを回転させる必要があります。

'>>tr|G1PEZ0|G1PEZ0_MYOLU Uncharacterized protein (Fragment) OS=Myotis lucifugus GN=SNCG PE=4 SV=1

それだけです：

'>G1PEZ0_MYOLU

前に出てくるアポストロフィは無視してください。

ベストアンサー1

これはどうですか：

str='>>tr|G1PEZ0|G1PEZ0_MYOLU Uncharacterized protein (Fragment) OS=Myotis lucifugus GN=SNCG PE=4 SV=1'
echo "$str" | sed -e 's/ .*//' -e 's/.*|//' -e 's/^/>/'

3つの別々の代替を使用します。つまり、行の最初のスペースから始めてすべてを削除し、行|の最後のスペースまですべてを削除してから、行の>最初の文字として再び追加します。

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