以下のfile1（私のパターンリスト）があります。
ファイル1
Fatty_acid_degradation
Aminobenzoate_degradation
Amino_sugar_and_nucleotide_sugar_metabolism
Amoebiasis
私はfile2（すべてのパターンリスト）を持っています。
ファイル2
Fatty_acid_degradation
Fatty_acid_degradation
Fatty_acid_degradation
Bacterial_invasion_of_epithelial_cells
Bacterial_invasion_of_epithelial_cells
Bacterial_invasion_of_epithelial_cells
Bacterial_invasion_of_epithelial_cells
file1の各パターンがfile2に表示される回数をgrepして計算し、次のテーブル（タブで区切った）を取得したいと思います。
Fatty_acid_degradation 3
ベストアンサー1
最も簡単な方法は、grep各パターンを数えて計算することです。
$ grep -Fwf file1 file2 | sort | uniq -c
3 Fatty_acid_degradation
オプションgrepは-f、検索するパターンのリストとしてファイルを提供し、パターンを-F正規表現ではなく文字列として扱う必要があることを指定し、パターンが単語全体に一致することを-w確認することです（したがって、反対とregulation_of_expression一致しません）。upregulation_of_excpression。
その後、目的のツールを使用してフォーマットを変更できます。
$ grep -Fwf file1 file2 | sort | uniq -c | sed -r 's/.*([0-9]+) *(.*)/\2\t\1/'
$ grep -Fwf file1 file2 | sort | uniq -c | perl -lane 'print "$F[1]\t$F[0]"'
$ grep -Fwf file1 file2 | sort | uniq -c | awk -vOFS="\t" '{print $2,$1}'
上記の項目をすべて返してください。
Fatty_acid_degradation 3