昨日私はいくつかの行列を生成するために私の古いプログラムを実行したかった。問題はそれがうまくいかなかったことです。次のエラーが発生します。
./matrixBinaryGenerator: error while loading shared libraries: libmpich.so.10: cannot open shared object file: No such file or directory
mpich
、mpich2
およびを再インストールしてみましたが、libmpich-dev
すべて正常に再インストールしても問題は解決しませんでした。
かなり初歩的な質問であることはわかりますが、このライブラリをどのようにインストールするのかご存知ですか?私は手動で(RPMなどから)インストールするのではなく、いくつかのリポジトリからインストールすることを好みます。
私のプログラムはPETSCを使用し、OSはUbuntu 14.10です。
これは私のMPIバージョンです。
HYDRA build details:
Version: 3.1
Release Date: Thu Feb 20 11:41:13 CST 2014
CC: gcc -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro
CXX: g++ -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro
F77: gfortran -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro
F90: gfortran -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro
Configure options: '--disable-option-checking' '--prefix=/usr' '--build=x86_64-linux-gnu' '--includedir=${prefix}/include' '--mandir=${prefix}/share/man' '--infodir=${prefix}/share/info' '--sysconfdir=/etc' '--localstatedir=/var' '--libdir=${prefix}/lib/x86_64-linux-gnu' '--libexecdir=${prefix}/lib/x86_64-linux-gnu' '--disable-maintainer-mode' '--disable-dependency-tracking' '--enable-shared' '--enable-fc' '--disable-rpath' '--disable-wrapper-rpath' '--sysconfdir=/etc/mpich' '--libdir=/usr/lib/x86_64-linux-gnu' '--includedir=/usr/include/mpich' '--docdir=/usr/share/doc/mpich' '--with-hwloc-prefix=system' '--enable-checkpointing' '--with-hydra-ckpointlib=blcr' 'build_alias=x86_64-linux-gnu' 'MPICHLIB_CFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security' 'MPICHLIB_CXXFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security' 'MPICHLIB_FFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4' 'MPICHLIB_FCFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4' 'CFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -O2' 'LDFLAGS=-Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro ' 'CPPFLAGS=-D_FORTIFY_SOURCE=2 -I/build/buildd/mpich-3.1/src/mpl/include -I/build/buildd/mpich-3.1/src/mpl/include -I/build/buildd/mpich-3.1/src/openpa/src -I/build/buildd/mpich-3.1/src/openpa/src -I/build/buildd/mpich-3.1/src/mpi/romio/include' 'CXXFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security' 'F77=gfortran' 'FFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -O2' 'FC=gfortran' 'FCFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4' '--cache-file=/dev/null' '--srcdir=.' 'CC=gcc' 'LIBS=-lrt -lcr -lpthread '
Process Manager: pmi
Launchers available: ssh rsh fork slurm ll lsf sge manual persist
Topology libraries available: hwloc
Resource management kernels available: user slurm ll lsf sge pbs cobalt
Checkpointing libraries available: blcr
Demux engines available: poll select
ベストアンサー1
最後に、私はこの問題に対する解決策を見つけました。私のシステムではlibmpich.so.10
この機能が利用できないことがわかりましたlibmpich.so.12
。だからシンボリックリンクを作成して動作しました:-)
注文する:
ln -s libmpich.so.10 libmpich.so.12