Forループを使用して、複数のファイル(aprilPlate.txt、mayPlate.txt、junePlate.txt、julyPlate.txt、augustPlate.txt)の特定の列のデータを解析したいと思います。
入力ファイル(aprilPlate.txt、mayPlate.txt、junePlate.txt、julyPlate.txt、augustPlate.txt)のデータは次のとおりです。
Incl Cal Ps Name Q Con Std Status
True 255 A1 Sample 1 35.86 0
True 255 A2 Sample 2 36.06 0
True 255 A3 Sample 3 17.45 0
True 255 A4 Sample 4 17.56 0
True 255 A5 Sample 5 17.55 0
True 255 A6 Sample 6 40.00 0
True 255 A7 Sample 7 36.38 0
True 255 A8 Sample 8 27.98 0
True 255 A9 Sample 9 27.95 0
True 255 A10 Sample 10 28.19 0
True 255 A11 Sample 11 36.93 0
True 255 A12 Sample 12 37.74 0
True 255 A13 Sample 13 17.88 0
True 255 A14 Sample 14 17.82 0
True 255 A15 Sample 15 17.90 0
.
.
.
FORループを使用して操作を実行できました。ただし、すべてのファイルから必要なデータを取得するには、スクリプト(下)でファイル名を手動で変更する必要があります。
#!/bin/bash
# parse the data of desire columns from target file
# rename the column name
# redirect the stdoutput to a text file
for z in A B;
do for i in 3 4 5 13 14 15;
do grep $z$i aprilPlate.txt |
awk -F "\t" '{print $3 "\t" $5}' |
sed -e 's/A[3-5]/st_SWC/g;s/A[1][0-9]/st_SWD/g;s/B[3-5]/st_TZC/g;s/B[1][0-9]/st_TZD/g;' >> stone.txt;
done;
done
for z in E F;
do for i in 8 9 10 18 19 20;
do grep $z$i aprilPlate.txt |
awk -F "\t" '{print $3 "\t" $5}' |
sed -e 's/E[8-9]\|E[1][0]/su_SWC/g;s/E[1][0-9]\|E[2][0]/su_SWD/g;s/F[8-9]\|F[1][0]/su_TZC/g;s/F[1][0-9]\|F[2][0]/su_TZD/g;' >> suy.txt;
done;
done
paste -d'\t' stone.txt suy.txt >> aprilPlate.data.txt
- 申し訳ありません。以前のコーディングに間違いがありました。修正が完了しました。
データファイルの解析結果は次のようになります。
st_SWC 17.45 su_SWC 28.85
st_SWC 17.56 su_SWC 28.79
st_SWC 17.55 su_SWC 28.82
st_SWD 17.88 su_SWD 29.24
st_SWD 17.82 su_SWD 29.18
st_SWD 17.90 su_SWD 29.23
st_TZC 18.06 su_TZC 25.99
st_TZC 18.09 su_TZC 25.98
st_TZC 18.13 su_TZC 26.02
st_TZD 17.75 su_TZD 25.00
st_TZD 17.70 su_TZD 25.01
st_TZD 17.69 su_TZD 24.98
聞きたいです。ファイルをスクリプトの3番目の変数として使用できますか?他のソリューションを歓迎します。
ベストアンサー1
このようなものがあなたに役立つでしょう
for file in aprilPlate.txt mayPlate.txt junePlate.txt julyPlate.txt augustPlate.txt;
do
for z in A B;
do for i in 3 4 5 13 14 15;
do grep $z$i $file |
awk -F "\t" '{print $3 "\t" $5}' |
sed -e 's/A[3-5]/SWC/g;s/A[1][0-9]/SWD/g;s/B[3-5]/TZC/g;s/B[1][0-9]/TZD/g;' >> stone.txt;
done;
done
<snip>
done