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Biopieces用のRubyとgemをインストールした後、Linuxの「make」コマンドは失敗します。

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Biopieces用のRubyとgemをインストールした後、Linuxの「make」コマンドは失敗します。

私たちはそれを試したいバイオフィルムツール、aoを実行した後、RubyやPerlなどの特定の依存関係が必要です。インストーラしたがって、一部のRuby gemをインストールすると、通常のLinux 'make'コマンドを実行できなくなります。

~$ make

/var/lib/gems/1.9.1/gems/make-0.3.1/bin/make:1:in `top (required)>': uninitialized constant ELF (NameError)
        from /usr/local/bin/make:23:in `load'
        from /usr/local/bin/make:23:in `<main>'

ルートディレクトリ/usr/bin/makeを指定すると機能します。

現在、私たちはバイオオフィスを使用しておらず、すべてを取り除くことができます。この問題を解決して以前の状態に戻ることはできますか？

ベストアンサー1

上記のリンクを見ると、ruby_installer.sh次に終わるのがわかります。

echo "All done. Now append the following to your ~/.bashrc file:"
echo "export PATH=\"$ruby_dir/bin:\$PATH\""
echo "Done"

これは、シェルがプログラムを見つけようとする最初の場所が$ruby_dir/bin（たとえば）であることを意味します。/usr/local/myruby/bin

/usr/local/myruby/binこれを変更するには、PATH変数をエコーし​​、最後に確認された場所になるように変更します。たとえば、

# echo $PATH
/usr/local/myruby/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin

# export PATH=/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/myruby/bin

# echo $PATH
/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/bin:/usr/local/myruby/bin

.bashrcそして、スクリプトで指定されたPATHを再変更することを忘れないでください。

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