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10000個の数字（行ではない）ごとにファイルを分割

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10000個の数字（行ではない）ごとにファイルを分割

次のファイルがあります。

chr19   61336212        +       0       0       CG      CGT    
chr19   61336213        -       0       0       CG      CGG    
chr19   61336218        +       0       0       CG      CGG    
chr19   61336219        -       0       0       CG      CGC    
chr19   61336268        +       0       0       CG      CGG    
chr19   61336269        -       0       0       CG      CGA    
chr19   61336402        +       0       0       CG      CGG    
chr19   61336403        -       0       0       CG      CGT

このファイルを2番目のフィールドの10000間隔（行ではなく数値間隔）ごとに分割したいと思います。したがって、このファイルの場合は、最初の行（61336212を含む行）から最大61346211（61336212 + 9999）を含む行に分割し、61346212から61356211まで分割したいと思います。ご覧のとおり、2番目のフィールド/列の数字は「塗りつぶされていません」です。

これを行う方法はありますか？

ベストアンサー1

awk 'NR==1 {n=$2}
     {
       file = sprintf("file.%.4d", ($2-n)/10000)
       if (file != last_file) {
         close(last_file)
         last_file = file
       }
       print > file
     }'

、...と書くでしょうfile.0000（ここではfile.0001数字は最初の行の数字です）。int(($2-n)/10000)n$2

ファイルの書き込みを停止するとすぐにファイルを閉じます。そうしないと、何百ものファイルの後に同時に開くファイル数の制限に達します（GNUはawkこの制限を解決できますが、パフォーマンスは急速に低下します）。

我々はこの数が常に増加すると仮定します。

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