☰

テーブルをマージして追加して複数のテーブルのマスターテーブルを作成する

tag-icon • tag-icon awk merge gawk table
テーブルをマージして追加して複数のテーブルのマスターテーブルを作成する

同じおよび異なるデータポイントを持つ同じ形式の複数のテーブルをマージして追加し、空のデータポイントに0を入力してすべてのテーブルをマージできますか？必須入力ファイルは次のとおりです。

ファイル1

17      64298926        0.000599042
17      64298927        0.000399361
17      64298992        0.000199681
17      64299103        0.000399361
17      64299131        0.000199681

ファイル2

17      64298959        0.76087
17      64299360        0.75
17      64299462        1
17      64299584        0.5

ファイル3

17      64298930        0.0016835
17      64298939        0.00117647
17      64298959        0.0888383
17      64298980        0.00111359
17      64299003        0.0011236
17      64299014        0.00239234
17      64299026        0.00132626
17      64299030        0.00125628
17      64299039        0.00112867
17      64299041        0.00112108
17      64299058        0.00110619
17      64299101        0.00114155
17      64299123        0.00114943
17      64299152        0.00115741

。
。
。
。
。ファイルN
まで

希望の出力は次のようにする必要があります

17  64298926    0.000599042 0   0
17  64298927    0.000399361 0   0
17  64298992    0.000199681 0   0
17  64299103    0.000399361 0   0
17  64299131    0.000199681 0   0
17  64298959    0   0.76087 0.0888383
17  64299360    0   0.75    0
17  64299462    0   1   0
17  64299584    0   0.5 0
17  64298930    0   0   0.0016835
17  64298939    0   0   0.00117647
17  64298980    0   0   0.00111359
17  64299003    0   0   0.0011236
17  64299014    0   0   0.00239234
17  64299026    0   0   0.00132626
17  64299030    0   0   0.00125628
17  64299039    0   0   0.00112867
17  64299041    0   0   0.00112108
17  64299058    0   0   0.00110619
17  64299101    0   0   0.00114155
17  64299123    0   0   0.00114943
17  64299152    0   0   0.00115741

追加される追加の列の数は、ファイル数のn-1でなければなりません。

これを行うための近道（一行）はありますか？

ベストアンサー1

長いawk一行：

awk '{keys[$2]=$1; filenames[FILENAME]++; values[FILENAME,$2]=$3}END{for (k in keys){printf("%s %s ", keys[k], k); for (f in filenames){printf("%s ", values[f,k]?values[f,k]:0)} printf("\n");}} ' File? | sort

上記のファイルに基づいた結果は次のとおりです。

17 64298926 0.000599042 0 0 
17 64298927 0.000399361 0 0 
17 64298930 0 0 0.0016835 
17 64298939 0 0 0.00117647 
17 64298959 0 0.76087 0.0888383 
17 64298980 0 0 0.00111359 
17 64298992 0.000199681 0 0 
17 64299003 0 0 0.0011236 
17 64299014 0 0 0.00239234 
17 64299026 0 0 0.00132626 
17 64299030 0 0 0.00125628 
17 64299039 0 0 0.00112867 
17 64299041 0 0 0.00112108 
17 64299058 0 0 0.00110619 
17 64299101 0 0 0.00114155 
17 64299103 0.000399361 0 0 
17 64299123 0 0 0.00114943 
17 64299131 0.000199681 0 0 
17 64299152 0 0 0.00115741 
17 64299360 0 0.75 0 
17 64299462 0 1 0 
17 64299584 0 0.5 0

出力区切り文字としてスペースをランダムに使用します。

拡張スクリプトは次のとおりです。

{
    keys[$2]=$1; 
    filenames[FILENAME]++; 
    values[FILENAME,$2]=$3
}
END {
    for (k in keys) {
        printf("%s %s ", keys[k], k); 
        for (f in filenames) { 
            printf("%s ", values[f,k]?values[f,k]:0)
        } 
        printf("\n");
    }
}

おすすめ記事