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値が欠落している文字列の挿入

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値が欠落している文字列の挿入

一部の行の特定の列に一部の値が欠落しているため、受信したテキストファイルを編集できません。たとえば、ファイルは（ほとんど）次のようになります。

ID10    dad    prbM    ATGD
ID11    mom    prbF    CDSF
ID12    mom        CGDS
ID13    dad    prbF    FSDD
ID14    mom        FDSF

ご覧のとおり、時にはprbすべてのアイテムが利用できない場合があります。アイテムが存在しないときに2つのタブが分離されていることがわかりました。タブ間に文字列を挿入する方法はありますか？たとえば、次のようになります。

ID10    dad    prbM    ATGD
ID11    mom    prbF    CDSF
ID12    mom    none    CGDS
ID13    dad    prbF    FSDD
ID14    mom    none    FDSF

ベストアンサー1

awkフィールドが実際にタブで区切られているとします。

awk -F '\t' -v OFS='\t' '$3 == ""{$3 = "none"};1' input.txt

これ：

  1. 入力フィールド区切り記号を単一のタブに設定（-F '\t'）
  2. 出力フィールド区切り記号をタブ（-v OFS='\t'）に設定
  3. 3番目のフィールドが空であることを確認し$3 == ""（）、空の場合は文字列に設定します。"none"
  4. そして常にline（1）を印刷してください。

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