awkを使用して大容量ファイルから数字を減算する方法

このような大きなファイルがあります。

AT5G44030,TAACARA,1000,+,200,206
AT5G44030,TAACARA,1000,+,418,424
AT5G44030,TAACARA,1000,+,773,779
AT5G44030,NGATT,1000,+,114,118
AT5G44030,NGATT,1000,+,267,271
....................................

最後に2つの列を追加し、5番目 - 3番目、6番目 - 3番目を減算しようとするため、最終ファイルは次のようになります。

AT5G44030,TAACARA,1000,+,200,206,-800,-794
AT5G44030,TAACARA,1000,+,418,424,-582,-576
AT5G44030,TAACARA,1000,+,773,779,-227,-221
AT5G44030,NGATT,1000,+,114,118,-886,-882
AT5G44030,NGATT,1000,+,267,271,-733,-729

.......................................

（途中で空行があってはならないことに注意してください）

awkまたはを使用してこれをどのように実行できますかsed？ファイルが非常に大きい（1M行）。