コマンドを使用してパイプラインを開始しました。一部の管理/サーバー上の理由から、ツールはノード上で実行する必要があります。このツールは、Pipeline.stepsというファイルでパイプラインのすべてのステップをトリガします。だから私がしたいことは
$ qsub -I
$ cd /path/to/my/tool/
$ ./launch-pipeline pipeline.steps
問題は、いくつかの手順を他のノードで並列化する必要があることです。ファイルの内容はpipeline.steps
次のとおりです。
step1:
write_pbs_script ${NAME}.pbs
qsub ${NAME}.pbs
setp2:
continue...
すでにノードでパイプラインを起動しているため、winを使用してqsub
新しく作成されたpbs
スクリプトは明らかに失敗します。ノードでパイプラインを開始し、そのノードの他のノードに新しいジョブをディスパッチするにはどうすればよいですか?