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テキストファイルの行を見つけて、他のファイルの出力に置き換えます。

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テキストファイルの行を見つけて、他のファイルの出力に置き換えます。

A、B 2つのファイルがあります。

File A
>Node1                  
...
>Node2
...

File B
>gb|KY551314.1| Influenza A virus (A/mallard/Idaho/AH0011522/2015(H7N7)) segment 
2 polymerase PB1 (PB1) and PB1-F2 protein (PB1-F2) genes, 
complete cds
Length=2316

>gb|KY561069.1| Influenza A virus (A/American green-winged teal/Missouri/15OS6591/2015(H11N9)) 
segment 1 polymerase PB2 (PB2) gene, complete 
cds
Length=2341

ファイルAの各NodeX行をファイルBの後続の項目に置き換えるには？結果は次のとおりです。

File A
>gb|KY551314.1| Influenza A virus (A/mallard/Idaho/AH0011522/2015(H7N7)) segment 2 polymerase PB1 (PB1) and PB1-F2 protein (PB1-F2) genes, complete ads Length=2316
...

>gb|KY561069.1| Influenza A virus (A/American green-winged teal/Missouri/15OS6591/2015(H11N9)) segment 1 polymerase PB2 (PB2) gene, complete ads Length=2341
...

ベストアンサー1

1つの方法は次のとおりですawk。

awk 'NR==FNR && /^>Node/ {
    $0 = ""
    for(i=0; i<=4; i++) {
        getline s <ARGV[2]
        $0 = $0 s
    }
}
NR==FNR' FileA FileB

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