接続:互換性のない結合フィールド

接続:互換性のない結合フィールド

test1.txtとtest2.txtという2つのファイルがあります。

sort -n -k 5 -k 6 -k 7 -t:   test1.txt
sort -n -k 5 -k 6 -k 7 -t:   test2.txt

エラーはありませんが、両方のファイルを結合しようとするとエラーが発生し、結合フィールド5と6が互換性がないというメッセージが表示されます。

join -e 0  -j 5 -j 6 -j 7 -t: test1.txt test2.txt >test
# join: incompatible join fields 5, 6

状況に応じた例は次のとおりです。

テキスト1.txt

chr2    120683995       120684016       STE00144:391:H7V5MALXX:2:1101:2473:9818        25      +

テキスト2.txt

chr2    150021705       150021726       STE00144:391:H7V5MALXX:3:1101:2544:23513       25      -

フィールド4の同じコンテキストを使用して2つのファイルを結合したいと思います。

ベストアンサー1

おすすめ記事