awkの出力を配列に保存し、コンマ区切り文字を含むファイルとして印刷します。

bashを使用して複数のディレクトリ（sims）を繰り返し、指定された文字列を検索し、配列内の各インデックスを関連する出力に設定し、各値にコンマ区切り文字を使用してその出力を印刷しようとしています。そして、セミコロン区切り文字を追加します。各ファイルを分離してください。効果的には、Excelで2回分割できるCSVを提供する必要があります。 「Total Energy」が見つかるたびに、すべての重要な情報は各ディレクトリの「Output」ファイルのフィールド3にあります。

現在テストされているディレクトリセットの場合、各出力ファイルには2500個のエネルギーが必要ですが、現在のコードではそれを見つけることができません（下記参照）。

これは私のコードです。

#/bin/bash/

saveIFS="$IFS"

#Step 1: Ask user for the range of sims they want
echo "What is the first sim?"
read simcount
echo "What is the last sim?"
read simend

#Step 2: Create the energy files with proper naming conventions and make sure they're empty
energies+="energies${simcount}-${simend}.csv"
fenergies+="final_energies${simcount}-${simend}.out"
touch $energies
touch $fenergies
< $energies
< $fenergies

#Step 3: Go through each directory, print all energies into proper files
while [ $simcount -le $simend ]; do
        echo $simcount
        cd $print'sim'$simcount                                 # Change to the directory of each specified sim
        energy=($(awk '/Total Energy/{ print $3 }' output))     # Print all energies from output into an array
        echo ${#energy[@]}
        fenergy=${energy[${#energy[@]}-1]}                      # Get the last energy in each file
        cd ../                                                  # Go up a directory
        IFS=","                                                 # Change the Internal Field Separator (IFS) to a comma
        echo "${energy[*]};" >> $energies                       # Expand the array of energies into an IFS-delimited list; print it into the new energies file
        echo "$fenergy" >> $fenergies                           # Put the final energy of each sim on a new line in the new final energies file
        ((simcount++))
done

IFS="$saveIFS"

exit 0

これにより、次の出力が提供されます。

$ e.sh
What is the first sim?
6
What is the last sim?
15
6
2500
7
1
8
1
9
1
10
1
11
1
12
1
13
1
14
1
15
1

これは、ループが最初に2500のエネルギーをすべて見つけたが、その後ループを通過するたびにawkの出力を配列に分割しないことを意味します。 $energys という新しいファイルに出力される代表的な例は次のとおりです。

-271.2872230353,-271.3198859908,-271.4166545741,-271.5362409096,-271.6700236287,-271.8068505329,-271.9076587286,...;
-273.2853761106
-273.2855419371
...
-273.2856368361
-273.2857720402
-273.2859963834;
-271.2872230353
-271.3198859908
-271.4166545741
...

明確にするために、ループの最初の反復が成功し、セミコロン区切り文字を使用して1行に配列を出力します。すべての後続の反復は配列に分割されず（または長さが1の配列を持つ）、次のディレクトリに移動する前に数千回繰り返されるようです。

しばらく検索してみましたが、なぜこれが起こるのかわかりません。また、各繰り返しが終わるたびにエネルギー設定を解除しようとしましたが、役に立ちませんでした。だから私の具体的な質問は次のとおりです。 awk出力を配列に分割することがループで最初は機能しますが、それ以降は機能しないのはなぜですか？試してみる価値のあるbashを使用してこの問題を解決するより良い効率的な方法はありますか？