ENAデータベースからダウンロードするデータ(fastq)がたくさんあります。
Example: ERS076383 ERS012262 ERS160574 ERS349280 etc
Link to download via browser:
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
リンクをaccession =に置き換えてtxtを1つずつダウンロードし、wgetを使用してfastqに関連付けられている各ftpリンクをダウンロードします。しかし、wgetからダウンロードすることはできません。
i tried:
wget https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt
[1] 61380
[2] 61381
[3] 61382
Redirecting output to 'wget-log'....
しかし、うまくいきません。
ベストアンサー1
次のようにURLを引用符で囲む必要があります。
wget 'https://www.ebi.ac.uk/ena/data/warehouse/filereport?accession=ERS076383&result=read_run&fields=fastq_ftp&download=txt'
またはアンパサンド(\&
)を避けてください。