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フィールドベースのファイル比較と追加

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フィールドベースのファイル比較と追加

2つのファイルを比較したいのですが、locus_file.txtは非常に大きなファイルで、atrr.txtは小さなファイルです。最初のファイルの最初の2つの列をatrr.txtの2番目の列と一致させ、プロパティを一緒に印刷したいと思います。

locus_file.txt: 大容量ファイル

LOC_Os02g47020, LOC_Os03g57840,0.88725114
LOC_Os02g47020, LOC_Os07g36080,0.94455624
LOC_Os02g47020, LOC_Os03g02590,0.81881344

attr.txt: 属性ファイル

blue LOC_Os02g47020
red  LOC_Os02g40830
blue LOC_Os07g36080
yellow LOC_Os03g57840
red LOC_Os03g02590

希望の出力：

LOC_Os02g47020, LOC_Os03g57840,0.88725114,blue, yellow
LOC_Os02g47020, LOC_Os07g36080,0.94455624,blue, blue
LOC_Os02g47020, LOC_Os03g02590,0.81881344,blue, red

注：たとえば、目的の出力の最初の行では、列4の色はatrr.txtのLOC_Os02g47020、列5の色はatrr.txtのLOC_Os03g57840です。

ベストアンサー1

解決策awk：

$ awk '
FNR == NR {a[$2] = $1;next}
{
    split($1,f1,",");
    split($2,f2,",");
    print $0,a[f1[1]],a[f2[1]];
}' OFS=, attr.txt locus_file.txt
LOC_Os02g47020, LOC_Os03g57840,0.88725114,blue,yellow
LOC_Os02g47020, LOC_Os07g36080,0.94455624,blue,blue
LOC_Os02g47020, LOC_Os03g02590,0.81881344,blue,red

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