lxml
RHELを実行しているスーパーコンピュータに自分のアカウントを呼び出すPythonモジュールをインストールしようとしています。
はいいいえルートアクセス権またはスーパーユーザー状態が必要です。
lxml
libxml2
とのdev / develバージョンには、libxslt
ビルドする必要があるヘッダーファイルが含まれているため必要です。ただし、スーパーコンピュータにはルートディレクトリに開発バージョンではなくバージョンがインストールされているため、ソースからビルドして開発バージョンlxml
を/usr
自分のディレクトリにインストールしました。home
どちらもスムーズに構築され、エラーは発生せず、必要なすべてのヘッダーファイルが$HOME/usr/local/include/libxml2/libxml
待っています。
ただし、試行するたびにルートディレクトリでpip install lxml
dev以外のlibxml2
&を使用しようとします。libxslt
/bin
[myusername@q0144 ~]$ pip install --install-option="--prefix=$HOME/python_modules" lxml
... (some unimportant messages) ...
Building against libxml2/libxslt in the following directory: /usr/local/lib
building 'lxml.etree' extension
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/usr/local/include -I/usr/local/include/libxml2 -I/tmp/pip_build_myusername/lxml/src/lxml/includes -I/N/soft/rhel6/python/2.7.3/include/python2.7 -c src/lxml/lxml.etree.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/lxml/lxml.etree.o -w
In file included from src/lxml/lxml.etree.c:346:
/tmp/pip_build_myusername/lxml/src/lxml/includes/etree_defs.h:9:31: error: libxml/xmlversion.h: No such file or directory
/tmp/pip_build_myusername/lxml/src/lxml/includes/etree_defs.h:11:4: error: #error the development package of libxml2 (header files etc.) is not installed correctly
...(many more lines saying that the headers are missing, etc.)
開発パッケージが間違ったパッケージを探していたため、正しくインストールされていないことを示す数十行もあります。
libxml2
インストールされた/バージョンをシステムで使用するにはどうすればよいですか?libxslt
私も$HOME/bin
最初$HOME/usr
にあった.cshrc
。
すべての基盤が含まれていることを確認するために、ソースtarballに含まれているドキュメントのlxml
指示に従ってソースからビルドしようとしました。build.txt
[myusername@q0144 lxml-3.3.5]$ python setup.py build_ext -i -I $HOME/usr/include/libxml2/libxml --without-cython --with-xslt-config=$HOME/usr/local/bin/xslt-config
Building lxml version 3.3.5.
Building without Cython.
Using build configuration of libxslt 1.1.28
Building against libxml2/libxslt in the following directory: /usr/local/lib
/N/soft/rhel6/python/2.7.3/lib/python2.7/distutils/dist.py:267: UserWarning: Unknown distribution option: 'bugtrack_url'
warnings.warn(msg)
running build_ext
building 'lxml.etree' extension
gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/usr/local/include -I/usr/include/libxml2 -I/N/hd00/myusername/Quarry/python_modules/lxml-3.3.5/src/lxml/includes -I/N/u/myusername/Quarry/usr/include/libxml2/libxml -I/N/soft/rhel6/python/2.7.3/include/python2.7 -c src/lxml/lxml.etree.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/lxml/lxml.etree.o -w
In file included from src/lxml/lxml.etree.c:346:0:
/N/hd00/rccaton/Quarry/python_modules/lxml-3.3.5/src/lxml/includes/etree_defs.h:
13:32: fatal error: libxslt/xsltconfig.h: No such file or directory
compilation terminated.
error: command 'gcc' failed with exit status 1
そのため、デフォルトではetcディレクトリで/user/local/lib
はなく同じ問題が発生しました。$HOME/user
この問題をどのように解決できますか?
ベストアンサー1
bin
両方のパッケージ(libxml2 / libxslt)のサブディレクトリがユーザーのディレクトリにあることを確認してくださいPATH
。これには、*-config
libxml2 / libxsltがインストールされている場所を見つけるためにlxmlをコンパイルするときに使用されるスクリプトが含まれています。
[pdobrogost@host /]$ echo $PATH
(...):/opt/libxslt-1.1.27/bin:/opt/libxml2-2.6.32/bin:(...)
[pdobrogost@host /]$ which xml2-config && which xslt-config
/opt/libxml2-2.6.32/bin/xml2-config
/opt/libxslt-1.1.27/bin/xslt-config