前のピリオドなしで現在のディレクトリのtarアーカイブを作成します。

これは、tarパラメータに指定した方法でパス構造が生成されるために発生します。だからあなたが準拠。ソースとしてアーカイブも同じ構造で作成されます。

これを試してみることができます（注：これは隠しファイルと一致しません。):

tar -czvf ../myarchive.tar.gz *

n.stのコメントとzhouxの回答情報で更新されました。

tar --xform s:'^./':: -czvf ../myarchive.tar.gz ./