2つのファイルをマージしたいです。前の質問と回答を見ましたが、目的の結果に一致するものはありません。
2つのcsvファイル（file1.csv、file2.csv）があります。 file1.csvとfile2.csvは長さが異なります。プログラムは両方のファイルをマージし、列1の入力に基づいて
両方のファイルのすべての内容を印刷する必要があります。
file1.csvには4つの列があります。
$ cat file1.csv
Contig_Spider_Gland_98_1_1,>Contig_Spider_Gland_98_1_1 [1169 - 963] (REVERSE SENSE),MQGHRRKLATPRQRAPRKERQRALLLRLQWRIGLQPCSRRNKSLDRKNIYWRYLVEYGSWKGRTHISDV,C#
Contig_Spider_Gland_98_7_3,>Contig_Spider_Gland_98_17965_1 [90 - 278],MADVEKTSCCTETKECCKDETCCENGQGACHTGKEECKDTCHKKACGCKAGEDCKCSDGKCGC,CC#CC#CC#C#C#C#C#C#C#C#C#C#
$ cat file2.csv
Contig_Spider_Gland_98_1_1, SignalP-4.1, SIGNAL, 1, 22, 0.808, YES
Contig_Spider_Gland_98_8_2, SignalP-4.1, SIGNAL 1, 20, 0.877, YES
出力
Contig_Spider_Gland_98_1_1,>Contig_Spider_Gland_98_1_1 [1169 - 963] (REVERSE SENSE),MQGHRRKLATPRQRAPRKERQRALLLRLQWRIGLQPCSRRNKSLDRKNIYWRYLVEYGSWKGRTHISDV,C#,Contig_Spider_Gland_98_1_1, SignalP-4.1, SIGNAL, 1, 22, 0.808, YES
Contig_Spider_Gland_98_7_3,>Contig_Spider_Gland_98_17965_1 [90 - 278],MADVEKTSCCTETKECCKDETCCENGQGACHTGKEECKDTCHKKACGCKAGEDCKCSDGKCGC,CC#CC#CC#C#C#C#C#C#C#C#C#C#,no match
ご協力ありがとうございます
ベストアンサー1
これはあなたが望むものですか？
join -t, file1.csv file2.csv -a 1 -o auto -e 'no match'
Contig_Spider_Gland_98_1_1,>Contig_Spider_Gland_98_1_1 [1169 - 963] (REVERSE SENSE),MQGHRRKLATPRQRAPRKERQRALLLRLQWRIGLQPCSRRNKSLDRKNIYWRYLVEYGSWKGRTHISDV,C# , SignalP-4.1, SIGNAL, 1, 22, 0.808, YES
Contig_Spider_Gland_98_7_3,>Contig_Spider_Gland_98_17965_1 [90 - 278],MADVEKTSCCTETKECCKDETCCENGQGACHTGKEECKDTCHKKACGCKAGEDCKCSDGKCGC,CC#CC#CC#C#C#C#C#C#C#C#C#C# ,no match,no match,no match,no match,no match,no match
file2の行も印刷する必要がある場合：
join -t, file1.csv file2.csv -a 1 -a2 -o auto -e 'no match'
Contig_Spider_Gland_98_1_1,>Contig_Spider_Gland_98_1_1 [1169 - 963] (REVERSE SENSE),MQGHRRKLATPRQRAPRKERQRALLLRLQWRIGLQPCSRRNKSLDRKNIYWRYLVEYGSWKGRTHISDV,C# , SignalP-4.1, SIGNAL, 1, 22, 0.808, YES
Contig_Spider_Gland_98_7_3,>Contig_Spider_Gland_98_17965_1 [90 - 278],MADVEKTSCCTETKECCKDETCCENGQGACHTGKEECKDTCHKKACGCKAGEDCKCSDGKCGC,CC#CC#CC#C#C#C#C#C#C#C#C#C# ,no match,no match,no match,no match,no match,no match
Contig_Spider_Gland_98_8_2,no match,no match,no match, SignalP-4.1, SIGNAL 1, 20, 0.877, YES,no match